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AI何以成“藥神”?|鈦媒體深度

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(圖片來源:Unsplash)

新藥研發(fā)是人類發(fā)展中極具風(fēng)險(xiǎn)和復(fù)雜度、耗時(shí)最漫長(zhǎng)的技術(shù)研究領(lǐng)域之ー。英國(guó)《自然》(Nature)雜志有一組數(shù)據(jù)顯示,新藥的研發(fā)成本大約是26億美元,耗時(shí)約10年,成功率不到十分之一。

2018年上映的《我不是藥神》電影中,慢性白血病患者需要終生服用的正版格列衛(wèi),一盒整板售價(jià)高達(dá)2.35萬元人民幣。患者為了維持生命,每年服用格列衛(wèi)成本就需要接近30萬元。高額的藥物研發(fā)成本,導(dǎo)致一些正版藥物在專利期售出天價(jià),加之一部分藥物尚未被納入醫(yī)保范疇,很多患者都面臨“救命藥吃不起”的窘境。

但隨著人工智能(AI)技術(shù)的迅猛發(fā)展,通過AI算法取代人力篩選,讓AI制造出藥物似乎正變?yōu)楝F(xiàn)實(shí)。數(shù)據(jù)顯示,相比傳統(tǒng)新藥研發(fā)每年將近2000億美元的費(fèi)用,使用AI技術(shù)可以減少約35%的新藥發(fā)現(xiàn)成本,周期時(shí)間也從5至10年縮短至1-2年,甚至有可能幾個(gè)月內(nèi)完成。

如今全球企業(yè)對(duì)AI制藥技術(shù)關(guān)注度明顯上升,關(guān)于AI新藥研發(fā)力度逐步增強(qiáng)。

近日,英國(guó)調(diào)研機(jī)構(gòu)Deep Pharma Intelligence發(fā)布的一份關(guān)于AI制藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展報(bào)告顯示,截至2021年第二季度,利用AI技術(shù)實(shí)現(xiàn)藥物發(fā)現(xiàn)、生物標(biāo)志物開發(fā)和先進(jìn)研發(fā)環(huán)境的企業(yè),全球大約有300家,另外有880多家投資機(jī)構(gòu)入局這一賽道。其中,有21家為CRO(合同研究組織)企業(yè),31家傳統(tǒng)藥企,以及29家科技化工公司。中國(guó)AI制藥企業(yè)占比達(dá)到2.5%,即大概有7-8家AI制藥公司總部在中國(guó)。

市場(chǎng)規(guī)模方面,沙利文聯(lián)合頭豹研究院發(fā)布的一份報(bào)告統(tǒng)計(jì)顯示,全球藥物研發(fā)市場(chǎng)持續(xù)增長(zhǎng),2020年規(guī)模達(dá)1915億美元(約合人民幣1.24萬億元),預(yù)計(jì)2023年達(dá)2168億美元。

其中,美國(guó)藥物研發(fā)市場(chǎng)2020年規(guī)模占41.83%,達(dá)801億美元;中國(guó)藥物研發(fā)市場(chǎng)規(guī)模持續(xù)增長(zhǎng),2020年達(dá)270億美元(約合人民幣1745.87億元),預(yù)計(jì)2023年達(dá)493億美元。該報(bào)告預(yù)計(jì),在2023年前,中國(guó)藥物研發(fā)市場(chǎng)規(guī)模有望超過美國(guó)的一半。

在萬億級(jí)市場(chǎng)規(guī)模下,眾多明星基金和投資人跑步入場(chǎng),包括比爾·蓋茨的基金會(huì)信托基金、谷歌風(fēng)投、BAI資本、軟銀愿景基金、紅杉、啟明創(chuàng)投、五源資本、真格基金等,這些機(jī)構(gòu)大多在AI制藥賽道中押注了晶泰科技、英矽智能、星藥科技(Galixir)等多家公司。

中國(guó)互聯(lián)網(wǎng)科技巨頭們也早已布局AI制藥。去年9月,騰訊推出AI驅(qū)動(dòng)藥物研發(fā)平臺(tái)“云深智藥(iDrug)”,用于臨床前的藥物設(shè)計(jì)、篩選和優(yōu)化;字節(jié)跳動(dòng)AI Lab去年12月開始在北京、上海和美國(guó)山景城招聘藥物發(fā)現(xiàn)科學(xué)家,開展AI驅(qū)動(dòng)的藥物發(fā)現(xiàn)和制造研究;隨后華為也發(fā)布了藥物研發(fā)算法工程師的招聘啟事,并和中科院上海藥物研究所合作,推出了基于AI開發(fā)平臺(tái)ModelArts的藥物聯(lián)邦學(xué)習(xí)服務(wù)。更早之前,百度、阿里巴巴也都已先行落子。

毫無疑問,AI+制藥,成為了當(dāng)下沒人敢錯(cuò)失的賽道。

不過,雖然眾多巨頭企業(yè)跑步入場(chǎng),但AI制藥行業(yè)存在巨大的未知數(shù),商業(yè)前景還有待驗(yàn)證,迄今為止還沒有一款由AI發(fā)現(xiàn)的新藥問世。上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院教授陳海峰指出,AI不是萬能的,這一技術(shù)如何改變制藥業(yè),還有諸多問題仍待解答。

那么,AI 制藥行業(yè)究竟是未來百億新藍(lán)海,還是像共享單車、社區(qū)團(tuán)購(gòu)一樣,資本蜂擁卻淪為燒錢大戰(zhàn)?

全球AI藥物研發(fā)企業(yè)不完全統(tǒng)計(jì)表格(來源:鈦媒體App)

從量變到質(zhì)變,AI開始尋藥

6月3日下午,中關(guān)村國(guó)家自主創(chuàng)新示范區(qū)會(huì)議中心,一場(chǎng)關(guān)于AI技術(shù)論壇上,一位外國(guó)演講嘉賓吸引了在場(chǎng)所有人的目光。

盡管臺(tái)下沒有任何翻譯設(shè)備,但在場(chǎng)所有人都聚精會(huì)神仔細(xì)看著演講者的PPT。中國(guó)著名神經(jīng)生物學(xué)家、清華大學(xué)藥學(xué)院長(zhǎng)聘教授魯白在論壇現(xiàn)場(chǎng)形容這位嘉賓是:“他是一位學(xué)者創(chuàng)業(yè),也是少見的既能發(fā)表論文,還能寫書的企業(yè)家。”

這位外國(guó)嘉賓就是AI新藥研發(fā)商英矽智能(Insilico Medicine)創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官、計(jì)算機(jī)科學(xué)家Alex Zhavoronkov博士。

Alex畢業(yè)于加拿大皇后大學(xué),后來在美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)取得生物技術(shù)碩士學(xué)位,在莫斯科國(guó)立大學(xué)獲得生物物理學(xué)博士學(xué)位,擁有計(jì)算機(jī)和生物兩個(gè)技術(shù)方向的求學(xué)經(jīng)歷。并曾在英國(guó)生物老年醫(yī)學(xué)研究基金會(huì)擔(dān)任首席科學(xué)官,他還是美國(guó)巴克衰老研究所的客座教授,甚至寫過一本名為《跨越衰老》的書。2014年,Alex創(chuàng)立了英矽智能這家公司。

此次演講中,Alex主要宣傳英矽智能在今年2月底發(fā)布的一項(xiàng)重要成果:在不到18個(gè)月內(nèi),英矽智能利用自主研發(fā)的AI藥物研發(fā)平臺(tái),完成了從概念到臨床前候選化合物發(fā)現(xiàn)的整個(gè)過程,發(fā)現(xiàn)了泛纖維化的新靶點(diǎn),并針對(duì)該靶點(diǎn)設(shè)計(jì)了治療特發(fā)性肺纖維化(IPF)的臨床前候選藥物,該候選藥物已被證明在臨床前的體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)中具有顯著療效,且成本遠(yuǎn)低于常規(guī)藥物發(fā)現(xiàn)的投入。

事實(shí)上,藥物研發(fā)是一個(gè)系統(tǒng)性工程。從生命科學(xué)的基礎(chǔ)研究開始,然后到靶標(biāo)(點(diǎn))的發(fā)現(xiàn)。靶標(biāo)是指和疾病進(jìn)程有關(guān)的,并且可與藥物分子相互作用的生物大分子,如蛋白質(zhì)或核酸等。

當(dāng)靶標(biāo)確定以后,就可以根據(jù)靶標(biāo)發(fā)掘潛在的命中化合物(Hit),然后通過數(shù)輪合成優(yōu)化,最后獲得臨床前候選化合物。藥物的臨床前研發(fā)主要包括藥學(xué)研究(CMC)、藥效學(xué)研究、藥代動(dòng)力學(xué)(DMPK)及安全性評(píng)價(jià),完成臨床前研發(fā)并申報(bào)臨床試驗(yàn)(IND)獲批后,方可在人體上開展臨床階段的研究。藥物的臨床階段研究同樣挑戰(zhàn)重重,I期、II期、III期臨床試驗(yàn),每一輪都面臨長(zhǎng)耗時(shí)和高風(fēng)險(xiǎn),完成了臨床試驗(yàn)后藥物需要提交上市申請(qǐng),只有獲批的藥物最終才能流入市場(chǎng)。

中科院院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所研究員蔣華良指出,每年全球只有30-50個(gè)新藥可以上市,原創(chuàng)新藥則更少,大概在15個(gè)左右。而人類的疾病共有4500多種,90%以上的藥是無藥可治的,做藥卻又是一個(gè)復(fù)雜的過程,需要上千種技術(shù),高風(fēng)險(xiǎn)、周期長(zhǎng)、投資高。例如,四大神經(jīng)退行性疾病之一的阿茲海默癥,近20年來僅上市了一款新藥。

傳統(tǒng)的新藥研發(fā)模式下,每一款新藥上市動(dòng)輒需要數(shù)十年,耗費(fèi)數(shù)十億美元,且90%以上的新藥都沒能走到終點(diǎn)。周期長(zhǎng)、成本高、成功率低是新藥研發(fā)面臨的普遍難題。

那么,英矽智能究竟是如何做到用AI技術(shù)進(jìn)行藥物研發(fā)的呢?

具體來說,英矽智能團(tuán)隊(duì)花了近7年的時(shí)間,構(gòu)建了數(shù)百個(gè)AI模型(每個(gè)模型負(fù)責(zé)一項(xiàng)特定任務(wù))集成到該公司自主研發(fā)的一體化AI平臺(tái) Pharma.AI中,并通過大量的組學(xué)數(shù)據(jù)、論文庫數(shù)據(jù)、臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等不斷地對(duì)AI算法進(jìn)行訓(xùn)練驗(yàn)證和迭代,從而開發(fā)了針對(duì)藥物研發(fā)三大痛點(diǎn)的AI藥物研發(fā)軟件,它們包括:創(chuàng)新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)引擎PandaOmics、小分子的設(shè)計(jì)和生成引擎Chemistry42、以及臨床試驗(yàn)結(jié)果預(yù)測(cè)平臺(tái)InClinico。

在創(chuàng)新藥物研發(fā)項(xiàng)目中,首先,團(tuán)隊(duì)利用PandaOmics引擎的復(fù)雜評(píng)分機(jī)制,通過數(shù)據(jù)分析幫助靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)(該項(xiàng)研究也發(fā)表在《Science》雜志中);其次,用經(jīng)過大量數(shù)據(jù)訓(xùn)練和驗(yàn)證的小分子設(shè)計(jì)引擎Chemistry42,基于蛋白結(jié)構(gòu)或者配體結(jié)構(gòu)進(jìn)行化合物的設(shè)計(jì)和篩選,幫助找到具有特定屬性的小分子化合物,實(shí)現(xiàn)從苗頭化合物的發(fā)現(xiàn)一直到臨床化合物的確定;第三,利用人工智能引擎InClinico,指導(dǎo)正確的臨床實(shí)驗(yàn)方案。

值得注意的是,Pharma.AI平臺(tái)通過處理多模態(tài)大數(shù)據(jù)并構(gòu)建復(fù)雜的疾病模型用于靶點(diǎn)選擇,實(shí)現(xiàn)包括數(shù)百個(gè)模塊,如生成式對(duì)抗神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(GAN)、自然語言處理(NLP)引擎和統(tǒng)計(jì)組件——所有模塊均可協(xié)同工作。 并在此基礎(chǔ)上再通過發(fā)現(xiàn)的20個(gè)驗(yàn)證靶點(diǎn)中篩選出了一個(gè)全新的靶點(diǎn),優(yōu)先用于進(jìn)一步分析。

簡(jiǎn)單來說,英矽智能就是通過大數(shù)據(jù)模型,讓AI技術(shù)實(shí)現(xiàn)推理創(chuàng)造,使得AI從量變走向質(zhì)變,探索新的藥物發(fā)現(xiàn)方法。通過AI平臺(tái)的深度學(xué)習(xí)算法和大數(shù)據(jù)計(jì)算,實(shí)現(xiàn)從靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)到化合物篩選,從化合物合成到臨床實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)優(yōu)化,最后走進(jìn)人體臨床實(shí)驗(yàn)全過程。

創(chuàng)新工場(chǎng)董事長(zhǎng)兼CEO李開復(fù)表示,AI技術(shù)的自動(dòng)化、規(guī)模化和可解釋性優(yōu)勢(shì),讓它成為極具潛力的藥物設(shè)計(jì)新思路。此次英矽智能的發(fā)明是一個(gè)完整的、產(chǎn)品化的解決方案,也標(biāo)志著業(yè)界首次對(duì)AI進(jìn)行科學(xué)驗(yàn)證,并將其用于新藥研發(fā)。“第一次把整個(gè)新藥研發(fā)流程打通”。

2021年6月,英矽智能完成2.55億美元C輪融資,領(lǐng)投方為華平投資,跟投方包括啟明創(chuàng)投、創(chuàng)新工場(chǎng)、CPE源峰、紅杉資本中國(guó)基金、BV百度風(fēng)投、禮來亞洲基金等20多家明星機(jī)構(gòu),堪稱豪華。據(jù)彭博社此前報(bào)道,英矽智能正考慮籌資約3億美元在美國(guó)IPO。

Alex告訴鈦媒體App,英矽智能正在靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、化合物設(shè)計(jì)、化合物合成優(yōu)化等領(lǐng)域布局,并計(jì)劃把自主研發(fā)的創(chuàng)新藥物管線推進(jìn)到臨床試驗(yàn)階段。據(jù)悉,英矽智能利用人工智能驅(qū)動(dòng)發(fā)現(xiàn)的、針對(duì)IPF的候選化合物已于去年底進(jìn)入臨床前研究階段,這將是全球范圍內(nèi)首例由人工智能發(fā)現(xiàn)的具有全新靶點(diǎn)、全新化合物的潛力藥物,預(yù)計(jì)在2021年底進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。

(圖片來源:受訪者提供)

與傳統(tǒng)藥物研發(fā)流程類似,目前AI制藥產(chǎn)業(yè)鏈大體分為:新藥發(fā)現(xiàn)(Drug discovery)——臨床前研究(Pre-clinical development)——臨床研究(Clinical development)——FDA審核批準(zhǔn)(Regulatory approval)——新藥上市等。而AI藥物研發(fā)主要聚焦的疾病領(lǐng)域?yàn)榘┌Y、精神類、心血管、肝腎腸胃、呼吸系統(tǒng)等。

不過現(xiàn)階段,大部分企業(yè)都集中于早期化合物合成與篩選,或者更早的靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)階段。

智源研究院發(fā)布的一份報(bào)告指出,在全球兩百多家在AI制藥賽道布局的公司中,一半以上都是在藥物發(fā)現(xiàn)階段,其中81家公司做新的侯選化合物的挖掘。

對(duì)此,BAI資本投資副總裁侯曉林對(duì)鈦媒體App表示,“出現(xiàn)這樣狀況的一個(gè)原因是,傳統(tǒng)新藥研發(fā)要超過10年,整個(gè)AI制藥企業(yè)也沒有發(fā)展這么久,長(zhǎng)的比如晶泰科技也是一家成立六年多的公司,短的也不到兩三年。從藥物研發(fā)到臨床試驗(yàn)的整個(gè)過程依然需要花很多時(shí)間,AI制藥企業(yè)無法跳過臨床前和臨床階段大量的實(shí)驗(yàn),直接成藥是不太現(xiàn)實(shí)的。”

成立13年以來,BAI資本累計(jì)投資超200家互聯(lián)網(wǎng)企業(yè),實(shí)現(xiàn)14個(gè)IPO和40余家獨(dú)角獸,主要布局中早期企業(yè),投資領(lǐng)域涵蓋零售、消費(fèi)及服務(wù),內(nèi)容及媒介創(chuàng)新,產(chǎn)業(yè)科技及軟件,前沿科技及底層技術(shù)等方面。在加入BAI之前,侯曉林畢業(yè)于清華大學(xué),就職于軟銀中國(guó)資本,任投資副總監(jiān),更早在百度任職。在AI制藥領(lǐng)域,侯曉林和BAI資本團(tuán)隊(duì)布局了星藥科技(Galixir)、星亢原neoX生物、康邁迪森等明星公司。

侯曉林認(rèn)為,AI的介入,可以減少大量的試錯(cuò)和返工時(shí)間,節(jié)省研發(fā)成本,縮短研發(fā)周期,這對(duì)藥廠和CRO公司來說是很有意義的事情。因此,盡管目前很多公司都在產(chǎn)業(yè)鏈早期階段,但隨著AI技術(shù)的不斷進(jìn)步,AI制藥公司有望布局整條產(chǎn)業(yè)鏈。

“早期藥物發(fā)現(xiàn)整體可以從另一角度分為兩個(gè)階段,生物機(jī)制發(fā)現(xiàn)階段和臨床前研究階段。像蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析、靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)都屬于前者,而化合物發(fā)現(xiàn)、活性、毒理、藥理優(yōu)化等環(huán)節(jié)屬于后者。AI可以預(yù)測(cè)超大規(guī)模的分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),更加準(zhǔn)確高效地預(yù)測(cè)分子的屬性,進(jìn)行虛擬篩選,大大提升了研發(fā)的速度、降低了研發(fā)的成本。”侯曉林在接受鈦媒體App專訪時(shí)表示。

實(shí)際上,在藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域,晶泰科技做的就是一個(gè)AI技術(shù)參與的閉環(huán)。據(jù)晶泰科技聯(lián)合創(chuàng)始人兼CEO馬健博士介紹,針對(duì)新靶點(diǎn),AI可以首先針對(duì)靶點(diǎn)結(jié)構(gòu),生成涵蓋了巨大的化學(xué)空間的化合物集,并從中初步篩選出一系列潛在有效的化合物;隨后,使用AI與基于量子物理原理的算法對(duì)這些分子的活性進(jìn)行篩選、排序,結(jié)合靶點(diǎn)和細(xì)胞層面的實(shí)驗(yàn),對(duì)化合物關(guān)鍵的成藥性質(zhì)進(jìn)行更精細(xì)的驗(yàn)證與優(yōu)化,并將真實(shí)世界實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)反饋給AI模型,用于新一輪的化合物生成、設(shè)計(jì),行程循環(huán)。如此迭代,可依靠AI與少量有針對(duì)性的合成實(shí)驗(yàn),快速、精確地鎖定各方面性質(zhì)理想的候選化合物。馬健認(rèn)為,晶泰科技自主獲得高質(zhì)量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與模型驗(yàn)證的能力是算法不斷完善提升、構(gòu)建數(shù)字孿生的藥物研發(fā)系統(tǒng)的關(guān)鍵。

晶泰科技(XtalPi)成立于2014年,是一家以數(shù)字化和智能化驅(qū)動(dòng)創(chuàng)新的AI藥物研發(fā)公司,其“底層物理計(jì)算結(jié)合AI”的模式頗受看好。2020年9月獲3.188億美元的C輪融資,稱其創(chuàng)造了當(dāng)時(shí)全球AI藥物研發(fā)領(lǐng)域融資額的最高紀(jì)錄。

馬健告訴鈦媒體App,目前晶泰科技的商業(yè)模式,更多是以藥物研發(fā)平臺(tái)進(jìn)行研發(fā)合作,服務(wù)藥企和客戶的需求。當(dāng)主要提供提供一站式藥物從頭發(fā)現(xiàn)、晶型預(yù)測(cè)在內(nèi)的算法預(yù)測(cè)與實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證相結(jié)合的研發(fā)服務(wù)。其中,與希格生科、Geode兩家生物科技公司合作,針對(duì)兩個(gè)尚無對(duì)癥藥物的癌癥靶點(diǎn)進(jìn)行AI新藥發(fā)現(xiàn),分別在半年左右獲得首創(chuàng)新藥(first-in-class)臨床前候選化合物(PCC),目前正在準(zhǔn)備或已經(jīng)進(jìn)入CMC環(huán)節(jié)。至于自有新藥管線,短期內(nèi)暫無計(jì)劃。

另外,可以發(fā)現(xiàn)一個(gè)現(xiàn)象,包括Alex、星藥創(chuàng)始人兼CEO李成濤博士、星亢原生物聯(lián)合創(chuàng)始人兼CEO陳航、冰洲石科技(AccutarBio)創(chuàng)始人范捷等AI新藥研發(fā)賽道企業(yè)創(chuàng)始人,均沒有從事傳統(tǒng)藥企的經(jīng)歷,大都與AI、量子、統(tǒng)計(jì)、計(jì)算機(jī)、生物學(xué)有關(guān)。這說明,AI制藥并非只有藥企產(chǎn)業(yè)的資深人士才能做到。

例如,陳航是美國(guó)麻省理工學(xué)院(MIT)物理化學(xué)博士,曾在美國(guó)華爾街對(duì)沖基金千禧年擔(dān)任基金經(jīng)理,創(chuàng)始團(tuán)隊(duì)均畢業(yè)于浙江大學(xué)竺可楨學(xué)院;而范捷2004年獲得加州伯克利大學(xué)生物統(tǒng)計(jì)學(xué)碩士,后來在洛克菲勒大學(xué)從事博士后研究;李成濤則是畢業(yè)于清華大學(xué)姚班,隨后在麻省理工學(xué)院獲得計(jì)算機(jī)博士學(xué)位,師從機(jī)器學(xué)習(xí)大牛Prof. Stefanie Jegelka and Prof. Suvrit Sra.等。

對(duì)于這一現(xiàn)象,侯曉林認(rèn)為,跨學(xué)科是未來科學(xué)研究的發(fā)展趨勢(shì),候選化合物需要更多的解析分子結(jié)構(gòu),與AI相關(guān)的交叉學(xué)科背景的人十分有優(yōu)勢(shì),因?yàn)樗麄儗?duì)于AI+制藥技術(shù)理解的更為深刻。借用BAI被投企業(yè)星亢原陳航博士的一句話來說:“一個(gè)產(chǎn)業(yè)不可能被自己老一代的人或是傳統(tǒng)的人顛覆掉,自己沒事顛覆自己干什么,只有新興的力量才可能。”按照技術(shù)顛覆傳統(tǒng)產(chǎn)業(yè)的思維,但可能是人工智能領(lǐng)域出來的人會(huì)更有動(dòng)力來把新元素、新角度融合到已有行業(yè)中來碰撞出新火花。

“這個(gè)領(lǐng)域其實(shí)是個(gè)偏交叉學(xué)科。雖然李成濤主攻AI領(lǐng)域,但他博士期間的方向或是時(shí)間和精力,其實(shí)花在了理解分子之間相互作用的關(guān)系上,從而解決分子之間的作用底層原理。而且,團(tuán)隊(duì)也會(huì)招聘從傳統(tǒng)藥企中出來的人,并不是說創(chuàng)始人一定要在藥企里面做過很長(zhǎng)時(shí)間。將AI技術(shù)和醫(yī)療大健康賽道的人組合在一起,才會(huì)推進(jìn)企業(yè)更快發(fā)展。”侯曉林表示。

AI新藥研發(fā)三大問題亟待解決

事實(shí)上,AI+制藥賽道屬于計(jì)算機(jī)與生物、化學(xué)等諸多學(xué)科交叉的生命科學(xué)技術(shù),高端復(fù)合型人才十分稀缺,商業(yè)模式尚不明確,產(chǎn)業(yè)也處于早期。加上AI大數(shù)據(jù)的“黑盒”,使得數(shù)據(jù)不同,各家技術(shù)路徑也不相同,導(dǎo)致整個(gè)產(chǎn)業(yè)呈現(xiàn)“散而小”的局面。

首先是商業(yè)模式尚不明確。企業(yè)需要合理地定位角色,選擇適合的商業(yè)模式。當(dāng)前,AI藥物研發(fā)真正意義上的產(chǎn)出較少,2019年4月,IBM公司因?yàn)樨?cái)務(wù)業(yè)績(jī)低迷,決定停止開發(fā)和銷售藥物開發(fā)工具——Watson AI套件。目前多數(shù)企業(yè)發(fā)展依賴融資,對(duì)AI+藥物研發(fā)技術(shù)創(chuàng)新企業(yè)來說,是自己做藥物研發(fā)還是CRO模式,是需要結(jié)合自身發(fā)展做出適合的選擇。

以美國(guó)AI制藥獨(dú)角獸Schrodinger(薛定諤)為例。創(chuàng)立于1990年,比爾·蓋茨、谷歌、啟明創(chuàng)投等投資的薛定諤于今年2月成功在美國(guó)納斯達(dá)克上市,股票代碼為SDGR。截至9月18日,薛定諤市值已經(jīng)達(dá)到44.2億美元。

但薛定諤發(fā)布的2021財(cái)年二季度財(cái)報(bào)中顯示出,AI新藥發(fā)現(xiàn)并非該公司核心收入,而且商業(yè)模式并不清晰。

財(cái)報(bào)顯示,薛定諤Q2收入為2980萬美元,同比增長(zhǎng)29%,整個(gè)上半年收入為6191.1萬美元。其中,Q2軟件收入2410萬美元,同比增長(zhǎng)15%,新藥發(fā)現(xiàn)業(yè)務(wù)收入570萬美元,同比增長(zhǎng)161%。軟件和新藥發(fā)現(xiàn)為薛定諤的兩大業(yè)務(wù)領(lǐng)域,前者為向藥企銷售AI制藥相關(guān)軟件,后者為開發(fā)自有新藥。

與此同時(shí),財(cái)報(bào)顯示薛定諤收入中相當(dāng)一部分并非來自其核心業(yè)務(wù),也就是投資所得收益。比如,2021財(cái)年Q1由于公允價(jià)格的調(diào)整,薛定諤持有的Morphic Therapeutics的股份為其帶來2480萬美元非現(xiàn)金收入。Q2則包含收購(gòu)與藥物發(fā)現(xiàn)計(jì)劃相關(guān)的知識(shí)產(chǎn)權(quán),以及薛定諤與百時(shí)美施貴寶合作的收入等。最終導(dǎo)致薛定諤第二季度凈虧損達(dá)到3497萬美元,相比同期的406.6萬美元大幅增長(zhǎng)。

AI制藥公司Schrodinger于2月在美國(guó)納斯達(dá)克上市(來源:Nasdaq官網(wǎng))

不過,侯曉林卻認(rèn)為,盡管從時(shí)間上看,國(guó)內(nèi)大數(shù)據(jù)和AI制藥行業(yè)起步略晚,但這個(gè)行業(yè)自身就比較新穎,從臨床I&II&III期到FDA/CFDA審核,整個(gè)過程尚需一段時(shí)間,但AI制藥公司階段性管線成果仍可通過“l(fā)icense out”模式商業(yè)變現(xiàn)。

Alex指出,英矽智能擁有三種收入來源的商業(yè)模式,但目前依然處于早期商業(yè)化。

首先,通過自研的人工智能藥物發(fā)現(xiàn)平臺(tái)推進(jìn)超過40個(gè)內(nèi)部在研項(xiàng)目,一旦這些內(nèi)部管線取得進(jìn)展,公司將尋求項(xiàng)目授權(quán)合作或自主推進(jìn)到臨床階段,繼而實(shí)現(xiàn)商業(yè)化;

第二,項(xiàng)目開發(fā)合作。對(duì)于擁有臨床管線的公司,如果想要布局創(chuàng)新的臨床前管道,它們會(huì)選擇與這個(gè)領(lǐng)域最前沿的公司,也就是英矽智能等企業(yè)合作,從新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)一直到臨床前候選化合物研究,并隨著項(xiàng)目合作的展開進(jìn)行里程碑付款;

第三,軟件授權(quán)合作。英矽智能會(huì)把AI軟件授權(quán)給制藥公司,當(dāng)這些軟件被布局在制藥公司內(nèi)部,使用者們可以從英矽智能多年的研究中受益,利用軟件加速藥物發(fā)現(xiàn)。Alex認(rèn)為,軟件收入可能沒有項(xiàng)目合作收入那么重要,但將有助于整個(gè)生態(tài)圈的發(fā)展。

“我們想成為生態(tài)圈的重要的一份子,向全世界提供英矽智能的藥物發(fā)現(xiàn)能力,”Alex說。

“我們的目標(biāo)不是迅速實(shí)現(xiàn)盈利,而是通過滿足廣大患者的需求,來贏得具有潛力的市場(chǎng)。我認(rèn)為,要實(shí)現(xiàn)真正令人驚嘆的財(cái)務(wù)回報(bào)需要數(shù)年時(shí)間,不僅對(duì)英矽智能而言如此,對(duì)其他公司也是如此,但這不會(huì)在一夜之間發(fā)生。另外,為了計(jì)算風(fēng)險(xiǎn)和回報(bào),投資者理解生物技術(shù)商業(yè)模式是非常重要的。因?yàn)樯锛夹g(shù)是一個(gè)非常有風(fēng)險(xiǎn)的行業(yè),它通常不僅關(guān)于研發(fā)成本而且關(guān)于成功的概率。”Alex對(duì)鈦媒體App表示,自2014年成立以來,英矽智能已與包括約翰霍普金斯大學(xué)、哥本哈根大學(xué)、諾華、強(qiáng)生、輝瑞、勃林格殷格翰、安斯泰來等頂尖院校及跨國(guó)制藥企業(yè)達(dá)成合作。

另外,藥企巨頭們也在不斷入局AI藥物研發(fā)中,未來可能會(huì)通過大筆資金、人才的投入,或取代AI新藥研發(fā)初創(chuàng)企業(yè)。

目前在全球藥企中,諾華、阿斯利康、楊森、輝瑞、默克、拜耳等在AI藥物研發(fā)上行動(dòng)積極。其中,諾華使用機(jī)器學(xué)習(xí)算法監(jiān)控和管理臨床試驗(yàn),輝瑞、賽諾菲、百時(shí)美施貴寶使用AI開發(fā)和分析藥物真實(shí)世界數(shù)據(jù),拜耳則借助AI功能套件,從藥物警戒數(shù)據(jù)庫中自動(dòng)提取藥物不良反應(yīng)記錄。

二是高端復(fù)合型人才缺失。AI藥物研發(fā)兼具信息科技和醫(yī)藥雙重屬性,既需要AI的人才也需要懂藥物研發(fā)的人才,需要培養(yǎng)一批具備交叉學(xué)科的復(fù)合型人才隊(duì)伍。

根據(jù)全球頂級(jí)期刊《科學(xué)》(Science)發(fā)布的報(bào)道顯示,常見藥物發(fā)現(xiàn)所需要的學(xué)科主要包括生物學(xué)、化學(xué)、AI計(jì)算等相關(guān)科學(xué)技術(shù)。

1、生物學(xué):檢測(cè)開發(fā);細(xì)胞生物學(xué);電生理學(xué);基因組學(xué)和分子生物學(xué);藥物;(行為)藥理學(xué);生理;蛋白質(zhì)生化、表達(dá)和合成;蛋白質(zhì)工程和生物制藥;蛋白質(zhì)組學(xué);結(jié)構(gòu)生物學(xué)和晶體學(xué);獸醫(yī)服務(wù);

2、化學(xué):分析化學(xué);藥物和合成化學(xué);合理化合物設(shè)計(jì);計(jì)算化學(xué);計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì);高通量篩選;

3、相關(guān)科學(xué):工程;數(shù)學(xué);統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù);生物和化學(xué)信息學(xué);IT、硬件和軟件設(shè)計(jì)等。

對(duì)此,馬健在接受鈦媒體App獨(dú)家采訪時(shí)指出,很少有定位于交叉學(xué)科的專業(yè),所以大部分人才在進(jìn)入晶泰科技這個(gè)團(tuán)隊(duì)后才開始涉獵、補(bǔ)充其他領(lǐng)域的知識(shí)。在晶泰科技的招聘過程中,也不強(qiáng)調(diào)“一專多能”,而是由許多在各自專業(yè)技術(shù)領(lǐng)域深耕多年的專家,組成一個(gè)密切合作的跨學(xué)科的研發(fā)團(tuán)隊(duì)。只有科學(xué)研究、工程問題、算法、算力整體獲得不斷的優(yōu)化和發(fā)展,達(dá)到一個(gè)技術(shù)臨界點(diǎn),才能解決復(fù)雜的AI新藥研發(fā)問題。

三是數(shù)據(jù)制約。AI訓(xùn)練模型需要優(yōu)質(zhì)的數(shù)據(jù),新藥研發(fā)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)基本掌握在藥企手里,公開的數(shù)據(jù)比較有限,所以如何獲取優(yōu)質(zhì)的數(shù)據(jù),建立研發(fā)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)體系完善數(shù)據(jù)都是AI+藥物研發(fā)初創(chuàng)公司面臨的難題。

對(duì)AI制藥企業(yè)而言,數(shù)據(jù)壁壘必須破除,但這并非易事。多位業(yè)內(nèi)人數(shù)指出,藥物研發(fā)中最核心的數(shù)據(jù)往往掌握在藥企手中。由于涉及核心知識(shí)產(chǎn)權(quán),藥企并無意愿將核心數(shù)據(jù)分享。而公開的數(shù)據(jù)質(zhì)量參差不齊,限制了AI發(fā)揮更大價(jià)值。

短期內(nèi),AI無法顛覆制藥工業(yè)的既有生態(tài)。不同項(xiàng)目中的AI模型差異巨大,如何訓(xùn)練完全依賴研究者自身的判斷。因此,制藥業(yè)積累經(jīng)驗(yàn)和知識(shí)依然有重要價(jià)值。

此外,AI制藥對(duì)于患者的高風(fēng)險(xiǎn)也是不可忽視的。讓人類吞下由AI技術(shù)制造出的藥物,風(fēng)險(xiǎn)十分之高,機(jī)器可以死機(jī)重啟,人無法通過科技形成“復(fù)活甲”。

總的來說,AI主要是神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的算法,而神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來自于神經(jīng)科學(xué)。但相比人腦中百億個(gè)神經(jīng)元,以及和神經(jīng)細(xì)胞組成的復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),現(xiàn)在AI的模型結(jié)構(gòu)太簡(jiǎn)單了。現(xiàn)階段,整體技術(shù)依然處于弱AI階段,沒有大量的算力、算法和大數(shù)據(jù),很難通過AI實(shí)現(xiàn)所有的新藥發(fā)現(xiàn),諸多技術(shù)、商業(yè)、產(chǎn)業(yè)難題仍待解決。

“我們今天其實(shí)只走了第一步。”李開復(fù)在談及AI制藥時(shí)認(rèn)為,盡管AI制藥取得了突破,且潛力巨大,但仍處在發(fā)展的極早期,仍需著力打通靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和藥物分子發(fā)現(xiàn)等環(huán)節(jié)。

啟明創(chuàng)投主管合伙人梁颕宇則認(rèn)為,若以1到10分來評(píng)判AI制藥的成熟程度,現(xiàn)階段大概是1分左右,“現(xiàn)在說AI 對(duì)醫(yī)療領(lǐng)域的潛在影響還過早”。

一位AI制藥從業(yè)人士指出,長(zhǎng)期以來,中國(guó)制藥行業(yè)被指源頭創(chuàng)新能力不足,對(duì)新靶點(diǎn)、新成藥機(jī)制的發(fā)現(xiàn)幾為空白,且成果轉(zhuǎn)化環(huán)節(jié)仍需打通。在將科學(xué)發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為新藥的經(jīng)驗(yàn)依舊欠缺的現(xiàn)狀下,除了要面對(duì)AI技術(shù)和歐美企業(yè)的差距,如何利用AI發(fā)揮最大價(jià)值,仍是中國(guó)制藥業(yè)面對(duì)的真問題。

蔣華良院士強(qiáng)調(diào),藥物研發(fā)加上AI這樣的一個(gè)技術(shù)前景是美好的,但是道路肯定是不平坦的。在藥物研發(fā)領(lǐng)域,AI永遠(yuǎn)代替不了人。但如果做藥的人不掌握AI技術(shù)的話,也永遠(yuǎn)做不過新藥研發(fā)企業(yè)。?

中國(guó)加注AI+制藥賽道

2019年,Alex做出了一個(gè)意外的舉動(dòng)——將英矽智能總部從約翰霍普金斯大學(xué)所在地美國(guó)馬里蘭州移到中國(guó)香港。

實(shí)際上,全球50%以上的AI制藥企業(yè)都位于美國(guó)。對(duì)此他解釋稱,中國(guó)正在創(chuàng)造絕佳的環(huán)境,所以他認(rèn)為公司總部搬到中國(guó)香港,有利于英矽智能未來發(fā)展。

“我把全副身家押在了中國(guó)生物技術(shù)的未來上。”Alex在接受鈦媒體App獨(dú)家采訪時(shí)表示,中國(guó)生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)過去更專注于更成熟和保守的靶點(diǎn)和靶標(biāo)。然而如今,中國(guó)正在加大對(duì)創(chuàng)新藥的投入,考慮到這樣一個(gè)辛勤耕耘的環(huán)境和各攸關(guān)方做出重要努力,他預(yù)測(cè)未來5年內(nèi),中國(guó)創(chuàng)新藥賽道將迎來一場(chǎng)大爆發(fā),會(huì)站在世界的醫(yī)藥創(chuàng)新中心。

在Alex看來,盡管AI制藥賽道這不會(huì)在一夜之間爆發(fā),可能需要10年或15年以上,但中國(guó)并不會(huì)在AI制藥技術(shù)中處于劣勢(shì)。

事實(shí)上,頂層政策設(shè)計(jì)方面,大數(shù)據(jù)和AI藥物設(shè)計(jì)已成為中國(guó)生命健康領(lǐng)域的戰(zhàn)略前沿方向。

早在2018年4月,衛(wèi)健委《全國(guó)醫(yī)藥信息化建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范(試行)》 指出,利用AI技術(shù)對(duì)疾病風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),實(shí)現(xiàn)醫(yī)學(xué)影像輔助診斷、臨床輔助診療、智能健康管理等;十四五規(guī)劃和2035年遠(yuǎn)景目標(biāo)綱要中,下一代AI技術(shù)和新藥研發(fā)都已列為關(guān)鍵創(chuàng)新技術(shù)之一開展攻關(guān)研究;科技部、中科院十四五戰(zhàn)略規(guī)劃調(diào)研中,都將AI新藥列為生命健康領(lǐng)域的前沿部署方向。

融資方面,AI藥物研發(fā)受資本追捧,2021年來,亦有數(shù)家中國(guó)AI制藥企業(yè)獲得大額融資,中國(guó)企業(yè)和投資人均瞄準(zhǔn)這一領(lǐng)域。

對(duì)于侯曉林來說,近兩個(gè)月內(nèi),她在AI制藥賽道布局的上述三個(gè)項(xiàng)目均公布了新的融資消息。

  • 7月8日,星亢原生物(neoX Biotech)完成了數(shù)千萬美元的A+輪融資,本輪投資方包括BAI資本、紅杉中國(guó)、五源資本等;
  • 8月4日,星藥科技(Galixir)宣布完成B輪融資,由上海人工智能產(chǎn)業(yè)投資基金領(lǐng)投,并且獲得BAI資本等老股東的繼續(xù)跟投;
  • 8月16日,計(jì)算化學(xué) ( CADD ) 和AI 驅(qū)動(dòng)的醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)“康邁迪森”(ComMedX)完成由BAI資本領(lǐng)投的Pre-A輪數(shù)千萬人民幣融資;
  • 百度CEO李彥宏創(chuàng)立并投資的生物計(jì)算平臺(tái)百圖生科,于7月30日宣布完成上億美元A輪融資。由GGV紀(jì)源資本領(lǐng)投,百度、君聯(lián)資本、藍(lán)馳創(chuàng)投、真知資本、襄禾資本跟投,公司董事長(zhǎng)李彥宏繼續(xù)追加投資。
  • .......

動(dòng)脈網(wǎng)統(tǒng)計(jì)顯示,2010年至2020年10月,海內(nèi)外有超過50家AI+新藥企業(yè)獲得了融資,合計(jì)融資總額超過45億美元。這其中,超過20億美元的融資發(fā)生在2019年至2020年。CB?Insights數(shù)據(jù)顯示,僅2020年前三季度,行業(yè)投資事件數(shù)量達(dá)到289起。根據(jù)Deep Pharma數(shù)據(jù)顯示,AI藥物研發(fā)相關(guān)領(lǐng)域融資總額從2014年2.2億美元,增長(zhǎng)至2020年的18.39億美元。

目前在未掛牌上市、利用AI推動(dòng)藥物發(fā)現(xiàn)的企業(yè)中,已有五家估值超10億美元,包括英矽智能、Benevolent AI、Exscientia(遞表即將上市)、Insitro、以及中國(guó)企業(yè)晶泰科技。

當(dāng)然,除了開頭的互聯(lián)網(wǎng)企業(yè)、以及AI科技企業(yè)布局AI制藥之外,大型藥企、CRO的入局也需要密切關(guān)注。

國(guó)內(nèi)CRO企業(yè)中,藥明康德積極布局AI制藥。2018年06月,其與英矽智能合作嘗試?yán)蒙蓪?duì)抗網(wǎng)絡(luò)(GAN)和強(qiáng)化學(xué)習(xí)(RL)等新型算法,針對(duì)全新的以及具有挑戰(zhàn)性的靶點(diǎn),為客戶開發(fā)理想的臨床前藥物候選分子。自2016年至今,藥明康德布局6家Al藥物研發(fā)企業(yè)投資,其中包括英矽智能、Engine Biosciences, Verge Genomics, Strateos、Insitro和薛定諤6家Al公司,其中薛定諤已上市。?

清華大學(xué)交叉研究院副教授曾堅(jiān)陽認(rèn)為,通過新技術(shù)對(duì)數(shù)據(jù)所有權(quán)的爭(zhēng)奪,或?qū)⒊蔀锳I制藥的下一個(gè)熱點(diǎn)。

今年7月,谷歌公司旗下DeepMind團(tuán)隊(duì)自研AI系統(tǒng)AlphaFold 2已經(jīng)能夠預(yù)測(cè)人類98.5%的蛋白結(jié)構(gòu)組(人類基因組編碼的所有蛋白質(zhì)的集合)研究成果,使得其海量蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫有望在藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域應(yīng)用,讓中國(guó)AI新藥研發(fā)企業(yè)找到了新藍(lán)海。

有數(shù)位行業(yè)資深人士對(duì)鈦媒體App表示,由于DeepMind這一研究成果的想象空間,導(dǎo)致很多投資人十分看好現(xiàn)在國(guó)內(nèi)AI制藥行業(yè)發(fā)展。

“DeepMind的研究對(duì)于AI制藥產(chǎn)業(yè)來說是一個(gè)很大的啟發(fā),對(duì)于整個(gè)AI制藥行業(yè)也是一個(gè)里程碑。它讓更多人關(guān)注到AI制藥行業(yè),以及源頭環(huán)節(jié)下游的瓶頸問題。”馬健博士近日在接受鈦媒體App獨(dú)家采訪時(shí)表示,DeepMind的這一成果如同打開了藥物創(chuàng)新的源頭活水,讓更多因?yàn)榻Y(jié)構(gòu)不清晰而難以成藥的靶點(diǎn)變得可望可及,而清晰的靶點(diǎn)蛋白結(jié)構(gòu)意味著AI算法有更好的施展空間,可以應(yīng)用的靶點(diǎn)與應(yīng)運(yùn)而生的藥物管線數(shù)量也會(huì)顯著增加,這對(duì)于整個(gè)AI制藥是一個(gè)重要利好。

實(shí)際上,隨著AI技術(shù)在醫(yī)療領(lǐng)域的全鏈條應(yīng)用,正不斷加速生物醫(yī)藥行業(yè)的范式轉(zhuǎn)變。但這無疑將耗時(shí)長(zhǎng)久,短期內(nèi),業(yè)界期盼的AI助力中國(guó)制藥業(yè)“彎道超車”幾無發(fā)生的可能。這主要由于制藥行業(yè)本身動(dòng)輒十幾、二十年的超長(zhǎng)研發(fā)周期。

曾堅(jiān)陽指出,AI在藥物研發(fā)中扮演的仍然是一種輔助性角色,核心仍是制藥乃至生物和化學(xué)專家的專業(yè)知識(shí)。制藥業(yè)積累的研發(fā)經(jīng)驗(yàn),是AI在制藥業(yè)發(fā)揮價(jià)值的前提。

大藥企積累的經(jīng)驗(yàn)和數(shù)據(jù),也促進(jìn)了AI本身的優(yōu)化。馬健坦言,通過與歐美藥企合作,晶泰自身的平臺(tái)與技術(shù)也得到了打磨和驗(yàn)證。目前晶泰科技通過結(jié)合智能藥物研發(fā)平臺(tái)與實(shí)驗(yàn)技術(shù)、以及藥物研發(fā)團(tuán)隊(duì)豐富的行業(yè)經(jīng)驗(yàn),就此建立起一套較成熟的AI藥物發(fā)現(xiàn)流程與全新研發(fā)范式。

侯曉林認(rèn)為,新藥研發(fā)是需要大量的資金、人才和技術(shù)投入,加之用藥安全性考慮,AI制藥賽道道路且長(zhǎng),還需要扎實(shí)的基礎(chǔ)科學(xué)研究和充分的臨床實(shí)驗(yàn)。

侯曉林強(qiáng)調(diào),“沒有那么多彎道可以超,踏踏實(shí)實(shí)做事還是少不了的。”

(本文首發(fā)鈦媒體App,作者|林志佳)

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